Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC27P30260 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC27P30260 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC27P30260 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDC27P30260 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDC27P30260 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDC27P30260 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDC27P30260 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDC27P30260 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDC27P30260 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms