Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOP1P11387 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1P11387 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1P11387 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1P11387 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1P11387 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1P11387 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1P11387 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1P11387 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1P11387 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1P11387 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1P11387 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOP1P11387 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1P11387 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1P11387 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1P11387 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1P11387 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1P11387 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1P11387 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1P11387 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1P11387 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1P11387 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1P11387 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1P11387 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP1P11387 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP1P11387 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP1P11387 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1P11387 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1P11387 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1P11387 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1P11387 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1P11387 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1P11387 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1P11387 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1P11387 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1P11387 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1P11387 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1P11387 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1P11387 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP1P11387 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP1P11387 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP1P11387 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TOP1P11387 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1P11387 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms