Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6AO75865 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6AO75865 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6AO75865 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6AO75865 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC6AO75865 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC6AO75865 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms