Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTNAP2Q9UHC6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms