Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 RPL9-208ENST00000508595 667 ntTSL 33.38□□□□□ -1.874e-7■■■■■ 29.4
RBM22Q9NW64 RPL9-202ENST00000437992 579 ntTSL 43.26□□□□□ -1.894e-7■■■■■ 29.4
RBM22Q9NW64 RPL9-204ENST00000503040 571 ntTSL 42.77□□□□□ -1.974e-7■■■■■ 29.4
RBM22Q9NW64 CARS2-218ENST00000539269 795 ntTSL 330.11■■■□□ 2.416e-8■■■■■ 29.4
RBM22Q9NW64 CARS2-231ENST00000544488 575 ntTSL 420.37■□□□□ 0.856e-8■■■■■ 29.4
RBM22Q9NW64 CARS2-226ENST00000541443 574 ntTSL 57.72□□□□□ -1.176e-8■■■■■ 29.4
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RBM22Q9NW64 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.154e-35■■■■■ 29.4
RBM22Q9NW64 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 211.76□□□□□ -0.534e-35■■■■■ 29.4
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RBM22Q9NW64 PTBP1-209ENST00000586481 578 ntTSL 319.98■□□□□ 0.797e-10■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 PTBP1-216ENST00000590887 642 ntTSL 313.27□□□□□ -0.297e-10■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 PTBP1-214ENST00000589575 749 ntTSL 313.13□□□□□ -0.317e-10■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 PTBP1-211ENST00000587094 273 ntTSL 311.49□□□□□ -0.572e-10■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 TKT-204ENST00000450814 1941 ntTSL 218.05■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 TKT-211ENST00000472528 1055 ntTSL 1 (best)15.44■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 TKT-210ENST00000469678 1871 ntTSL 514.91□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 U2SURP-211ENST00000488497 3557 ntTSL 1 (best)6.32□□□□□ -1.43e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.683e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.763e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 U2SURP-203ENST00000463563 4364 ntTSL 22.18□□□□□ -2.063e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 TM9SF4-201ENST00000217315 4032 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 ALDH18A1-203ENST00000483788 750 ntTSL 319.81■□□□□ 0.769e-15■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 DDB1-217ENST00000540166 3906 ntTSL 28.46□□□□□ -1.055e-7■■■■■ 29.3
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RBM22Q9NW64 PABPC4-211ENST00000474378 591 ntTSL 55.07□□□□□ -1.61e-7■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.18e-8■■■■■ 29.3
RBM22Q9NW64 PHF19-213ENST00000487555 1092 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.038e-8■■■■■ 29.3
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RBM22Q9NW64 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.788e-8■■■■■ 29.3
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RBM22Q9NW64 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 29.2
RBM22Q9NW64 TNKS1BP1-204ENST00000528882 4336 ntTSL 515.91■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 29.2
RBM22Q9NW64 SETD5-210ENST00000442373 900 ntTSL 59.43□□□□□ -0.94e-8■■■■■ 29.2
RBM22Q9NW64 SETD5-226ENST00000490791 667 ntTSL 36.77□□□□□ -1.334e-8■■■■■ 29.2
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RBM22Q9NW64 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.063e-8■■■■■ 29.2
RBM22Q9NW64 EIF3D-207ENST00000457241 729 ntTSL 215.46■□□□□ 0.077e-7■■■■■ 29.1
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RBM22Q9NW64 EIF3D-205ENST00000432675 678 ntTSL 210.82□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 29.1
RBM22Q9NW64 EIF3D-206ENST00000455547 996 ntTSL 59.96□□□□□ -0.827e-7■■■■■ 29.1
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RBM22Q9NW64 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 29.1
RBM22Q9NW64 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 29.1
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RBM22Q9NW64 ELOVL5-205ENST00000485336 761 ntTSL 59.07□□□□□ -0.963e-9■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.133e-9■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.233e-9■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.373e-9■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-9■■■■■ 29
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RBM22Q9NW64 SLC12A7-206ENST00000634447 3142 ntTSL 513.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.693e-6■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 RHEB-205ENST00000478470 1153 ntTSL 525.01■■□□□ 1.593e-6■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 SF1-214ENST00000477596 802 ntTSL 222.53■■□□□ 1.27e-13■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.863e-6■■■■■ 29
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RBM22Q9NW64 AFF1-204ENST00000503477 1478 ntTSL 217.12■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 HGS-204ENST00000571237 878 ntTSL 316.38■□□□□ 0.217e-13■■■■■ 29
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RBM22Q9NW64 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 RRM2-206ENST00000474701 1060 ntTSL 214.16□□□□□ -0.147e-13■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 SF1-210ENST00000443908 767 ntTSL 313.66□□□□□ -0.227e-13■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 SF1-206ENST00000413725 843 ntTSL 213.36□□□□□ -0.277e-13■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 SF1-216ENST00000486867 875 ntTSL 313.27□□□□□ -0.297e-13■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 RRM2-203ENST00000459969 787 ntTSL 211.15□□□□□ -0.627e-13■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 AFF1-202ENST00000395146 9285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 AFF1-210ENST00000514970 582 ntTSL 39.96□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 HIPK1-206ENST00000369559 3424 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 HIPK1-203ENST00000369553 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 AFF1-211ENST00000544085 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 29
RBM22Q9NW64 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.383e-6■■■■■ 29
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