Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOBEC3GQ9HC16 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOBEC3GQ9HC16 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms