Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GABARAPL3Q9BY60 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms