Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRAMP1Q96RY5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms