Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
YTHDC1Q96MU7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
YTHDC1Q96MU7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
YTHDC1Q96MU7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms