Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLF2Q8IX21 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLF2Q8IX21 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms