Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMBRD2Q68DH5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMBRD2Q68DH5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms