Protein–RNA interactions for Protein: Q5W186

CST9, Cystatin-9, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST9Q5W186 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CST9Q5W186 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CST9Q5W186 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CST9Q5W186 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST9Q5W186 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CST9Q5W186 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST9Q5W186 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST9Q5W186 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST9Q5W186 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST9Q5W186 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms