Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SPIN3Q5JUX0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPIN3Q5JUX0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms