Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 AL136531.2-201ENST00000618770 1164 ntTSL 220.47■□□□□ 0.871e-7■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.431e-7■■■■□ 21.3
PCBP1Q15365 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.051e-8■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.041e-7■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.171e-7■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 MAZ-207ENST00000563012 646 ntTSL 322.09■■□□□ 1.132e-8■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.283e-7■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.312e-9■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.115e-6■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.687e-7■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.637e-7■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.447e-7■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.247e-7■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 TRMT112-205ENST00000539854 659 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.627e-7■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.231e-7■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.631e-7■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 CTSH-215ENST00000534237 691 ntTSL 312.23□□□□□ -0.451e-10■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 CTSH-204ENST00000527715 2138 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.511e-10■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 PABPC1-203ENST00000517921 885 ntTSL 511.52□□□□□ -0.579e-40■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 PABPC1-222ENST00000523555 522 ntTSL 310.5□□□□□ -0.739e-40■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 CYP2F2P-201ENST00000437853 1056 ntBASIC14.01□□□□□ -0.176e-9■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 CYP2F2P-202ENST00000641827 1004 ntBASIC11.02□□□□□ -0.656e-9■■■■□ 21.2
PCBP1Q15365 CUL5-201ENST00000393094 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.631e-18■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 CUL5-203ENST00000531427 3596 ntTSL 1 (best)7.96□□□□□ -1.141e-18■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.491e-18■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 RALY-206ENST00000448364 1204 ntTSL 226.99■■□□□ 1.913e-8■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 RALY-204ENST00000413297 766 ntTSL 523.17■■□□□ 1.33e-8■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 RALY-202ENST00000333552 786 ntTSL 322.81■■□□□ 1.242e-8■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 TCF3-216ENST00000592395 996 ntTSL 520.64■□□□□ 0.892e-7■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 TCF3-217ENST00000592628 1751 ntTSL 517■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 TCF3-211ENST00000587425 629 ntTSL 216.89■□□□□ 0.292e-7■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 TCF3-218ENST00000593064 2694 ntTSL 215.45■□□□□ 0.062e-7■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 ATXN2L-218ENST00000565971 3264 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.125e-8■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.345e-8■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 FLOT2-204ENST00000577789 2503 ntTSL 516.98■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 FLOT2-206ENST00000580805 2679 ntTSL 516.79■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-6■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 317.52■□□□□ 0.41e-17■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.092e-6■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.018e-7■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 RNF214-205ENST00000531287 1706 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.188e-7■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 RNF214-202ENST00000524917 545 ntTSL 410.86□□□□□ -0.678e-7■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 RNF214-204ENST00000530849 2846 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.98e-7■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 RNF214-206ENST00000531452 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -18e-7■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 RNF214-208ENST00000534709 978 ntTSL 1 (best)8.45□□□□□ -1.068e-7■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.532e-6■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 21.1
PCBP1Q15365 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.851e-7■■■■□ 21
PCBP1Q15365 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.721e-7■■■■□ 21
PCBP1Q15365 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.199e-8■■■■□ 21
PCBP1Q15365 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.958e-8■■■■□ 21
PCBP1Q15365 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.418e-8■■■■□ 21
PCBP1Q15365 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.838e-7■■■■□ 21
PCBP1Q15365 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.032e-14■■■■□ 21
PCBP1Q15365 HOOK3-205ENST00000533338 774 ntTSL 35.51□□□□□ -1.532e-14■■■■□ 21
PCBP1Q15365 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.552e-14■■■■□ 21
PCBP1Q15365 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.071e-6■■■■□ 21
PCBP1Q15365 ATP5D-208ENST00000592624 1587 nt21.45■■□□□ 1.021e-6■■■■□ 21
PCBP1Q15365 ATP5D-203ENST00000588538 1393 ntTSL 1 (best)21.23■□□□□ 0.991e-6■■■■□ 21
PCBP1Q15365 ATP5D-205ENST00000590265 1144 ntTSL 1 (best)20.61■□□□□ 0.891e-6■■■■□ 21
PCBP1Q15365 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 21
PCBP1Q15365 EIF4G1-223ENST00000444134 558 ntTSL 511.86□□□□□ -0.516e-8■■■■□ 21
PCBP1Q15365 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 415.3■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 DNAJC6-207ENST00000494710 1621 ntTSL 527.47■■□□□ 1.999e-11■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.169e-11■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.279e-11■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 DNAJC6-206ENST00000483402 409 ntTSL 36.62□□□□□ -1.359e-11■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 DNAJC6-204ENST00000463018 546 ntTSL 36.34□□□□□ -1.399e-11■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 CHPT1-202ENST00000546490 476 ntTSL 220.88■□□□□ 0.934e-29■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 GABBR1-201ENST00000355973 3506 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.441e-6■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 GABBR1-203ENST00000377012 4104 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.451e-6■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.072e-6■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.592e-10■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 SSBP4-203ENST00000593641 900 ntTSL 525.25■■□□□ 1.632e-10■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.546e-29■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.216e-29■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.16e-29■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.296e-29■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.696e-29■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.21e-7■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.571e-7■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.353e-6■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.781e-7■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.648e-9■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 RABL6-210ENST00000484471 2746 ntTSL 519.69■□□□□ 0.746e-8■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.386e-8■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.366e-8■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 216.81■□□□□ 0.288e-9■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.161e-7■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 RABL6-206ENST00000436380 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.03■□□□□ -01e-7■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.491e-7■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 SMG7-201ENST00000347615 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-7■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.011e-7■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 HM13-212ENST00000469097 801 ntTSL 512.84□□□□□ -0.355e-9■■■■□ 20.9
PCBP1Q15365 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)23.52■■□□□ 1.363e-12■■■■□ 20.8
PCBP1Q15365 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 220.46■□□□□ 0.873e-12■■■■□ 20.8
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