Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHD4Q14839 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
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CHD4Q14839 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
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CHD4Q14839 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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CHD4Q14839 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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CHD4Q14839 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHD4Q14839 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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