Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMC2Q13753 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMC2Q13753 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms