Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NEUROD1Q13562 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NEUROD1Q13562 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
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