Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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FOXC1Q12948 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXC1Q12948 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
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FOXC1Q12948 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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FOXC1Q12948 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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FOXC1Q12948 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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FOXC1Q12948 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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FOXC1Q12948 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXC1Q12948 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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