Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CSNK2A1P68400 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms