Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERFP50548 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERFP50548 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ERFP50548 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERFP50548 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERFP50548 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERFP50548 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERFP50548 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERFP50548 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERFP50548 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERFP50548 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERFP50548 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERFP50548 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERFP50548 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERFP50548 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERFP50548 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERFP50548 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERFP50548 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERFP50548 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERFP50548 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms