Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VEGFBP49765 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VEGFBP49765 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms