Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPL35P42766 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL35P42766 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL35P42766 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL35P42766 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL35P42766 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL35P42766 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL35P42766 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms