Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECI1P42126 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECI1P42126 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECI1P42126 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ECI1P42126 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECI1P42126 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECI1P42126 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECI1P42126 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ECI1P42126 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ECI1P42126 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ECI1P42126 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ECI1P42126 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECI1P42126 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms