Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHRNA7P36544 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms