Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHMLP26374 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMLP26374 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMLP26374 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMLP26374 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMLP26374 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMLP26374 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMLP26374 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMLP26374 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMLP26374 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMLP26374 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMLP26374 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMLP26374 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMLP26374 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMLP26374 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMLP26374 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMLP26374 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMLP26374 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMLP26374 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMLP26374 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMLP26374 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMLP26374 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMLP26374 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMLP26374 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMLP26374 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMLP26374 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMLP26374 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMLP26374 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMLP26374 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms