Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1P21675 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1P21675 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1P21675 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF1P21675 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF1P21675 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1P21675 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1P21675 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1P21675 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1P21675 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1P21675 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1P21675 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1P21675 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF1P21675 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1P21675 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1P21675 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1P21675 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1P21675 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1P21675 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1P21675 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1P21675 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1P21675 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1P21675 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1P21675 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1P21675 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TAF1P21675 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1P21675 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1P21675 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1P21675 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1P21675 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1P21675 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1P21675 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1P21675 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1P21675 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1P21675 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1P21675 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1P21675 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1P21675 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1P21675 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1P21675 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1P21675 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1P21675 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms