Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB3P16520 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB3P16520 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB3P16520 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB3P16520 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB3P16520 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB3P16520 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB3P16520 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB3P16520 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB3P16520 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB3P16520 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GNB3P16520 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GNB3P16520 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GNB3P16520 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GNB3P16520 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GNB3P16520 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GNB3P16520 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms