Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CXCL13O43927 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CXCL13O43927 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms