Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREB3O43889 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREB3O43889 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREB3O43889 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3O43889 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3O43889 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3O43889 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3O43889 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3O43889 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3O43889 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3O43889 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3O43889 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3O43889 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREB3O43889 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CREB3O43889 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CREB3O43889 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms