Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LANCL1O43813 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LANCL1O43813 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms