Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PMD0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PMD0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PMD0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PMD0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PMD0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PMD0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PMD0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PMD0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PMD0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E9PMD0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E9PMD0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E9PMD0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E9PMD0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E9PMD0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PMD0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PMD0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PMD0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PMD0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PMD0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PMD0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PMD0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E9PMD0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms