Protein–RNA interactions for Protein: A6NC78

GOLGA8IP, Putative golgin subfamily A member 8I, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8IPA6NC78 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLGA8IPA6NC78 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8IPA6NC78 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8IPA6NC78 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8IPA6NC78 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8IPA6NC78 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8IPA6NC78 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8IPA6NC78 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8IPA6NC78 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8IPA6NC78 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8IPA6NC78 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8IPA6NC78 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8IPA6NC78 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8IPA6NC78 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLGA8IPA6NC78 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms