Protein–RNA interactions for Protein: A6NC62

RBAKDN, Putative RBAK downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAKDNA6NC62 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBAKDNA6NC62 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBAKDNA6NC62 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms