Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms