Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTF2Q9UNY4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTF2Q9UNY4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms