Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMCC3Q9ULS5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMCC3Q9ULS5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms