Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN3Q9P232 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms