Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms