Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAR1AQ9NR31 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAR1AQ9NR31 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms