Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NRIP3Q9NQ35 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRIP3Q9NQ35 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms