Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM31Q9BZY9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms