Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP9

Putative uncharacterized protein MGC13053, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9BRP9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q9BRP9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Q9BRP9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Q9BRP9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Q9BRP9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9BRP9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9BRP9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Q9BRP9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms