Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNBD2Q96M20 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms