Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX11Q96FC9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX11Q96FC9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms