Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC46A3Q7Z3Q1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC46A3Q7Z3Q1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC46A3Q7Z3Q1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SLC46A3Q7Z3Q1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC46A3Q7Z3Q1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC46A3Q7Z3Q1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC46A3Q7Z3Q1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC46A3Q7Z3Q1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLC46A3Q7Z3Q1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms