Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCSD1Q6JBY9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCSD1Q6JBY9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms