Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MS4A13Q5J8X5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MS4A13Q5J8X5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms