Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SGO2Q562F6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SGO2Q562F6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms