Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNA1SQ13698 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA1SQ13698 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
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