Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CALCOCO2Q13137 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CALCOCO2Q13137 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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